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優良水稻種原攸關稻米品質至距，因此水稻採種田間必須適時進行去偽去雜作業，其目的即在於保持良質水稻品種之遺傳特性及純度，使育成之優良品種不致於因異品種及雜草混雜，或病蟲害之感染而逐漸失去原品種之優良特性。水稻採種田間為避免品種混雜，應優先慎選採種田設置地點，原則以前期作休耕轉作田區或固定種植相同水品種稻田為宜，以免前作收穫後落粒稻種混雜。栽培田間宜適當放寬栽植密度，保持田間通風狀況良好，減輕採種田田間病蟲為害。有機質肥料施用不宜過量，並儘早於前期施用，以促進水稻有效分蘗；生育後期減施肥料，避免有機質肥料蓄積過量造成植株徒長及誘發病蟲害。水稻生育初期保持田間湛水狀態以減少雜草發生機率；生育中期拔除田間間生秧苗及雜草，以防雜草及異品種混雜；水稻抽穗前及齊穗後再次進行去偽去雜作業以確保稻種品種專一性。採種田水稻宜充分成熟時再行收穫，稻穀乾燥含水率宜降至13％以下，以利稻種貯放。採收乾燥後之稻種亦應適當貯存以確保種子發芽能力。