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芒果為深根性多年生果樹，根的主要功能除有固定植株外，可從土壤中吸收水分及養分，同時也能貯藏營養物質。一般而言，由播種且未經移植的實生苗，具有明顯的主根，粗大而直生，因此植株頗有耐旱、耐水及耐風等特性，而經移植的實生苗或嫁接苗，則因無明顯主根，樹齡較實生苗短，耐旱、耐水及耐風均較差。
根群之發育與品種及所生長的土壤條件之關係密切，在來種和金煌品種之根群最廣且深，美國品種次之，台農一號根群之分佈則較淺且窄。栽培地之土壤條件不同，根群的分佈也不同，在土層深厚，地下水位低，通氣性良好，有機質含量豐富的土地，根群之分佈較寬廣，植株生育也較旺盛，然營養生長過盛，常影響生殖生長。