臺灣草苺炭疽病菌族群分析與檢測技術開發
草苺為臺灣具高經濟價值之作物,栽培面積為500 公頃左右。近10 年來炭疽病成為草苺頭號殺手,自2010~2018 年間調查草苺主要產區,高達50% 以上的病株呈現典型冠腐病徵,經過型態及多基因分析52 株菌,確認造成臺灣草苺炭疽病之病原菌包含Colletotrichum siamense、C. fructicola (C. gloeosporioides species complex) 、C. karstii、C. boninense (C. boninense species complex)及一種歸類於C. acutatum species complex 的新種Colletotrichum miaoliense sp. nov.。其中又以C. siamense 為最主要且生長速度快、病原性強之病原菌,瞭解炭疽病菌種類將有助於後續防治策略之開發。由於炭疽病菌能潛伏感染寄主,種植健康不帶菌的草苺苗,將可大幅降低本田期病害的發生,同時減少化學藥劑的使用。而為生產健康的草苺苗,準確、靈敏、快速又合乎成本效益的檢測技術便是其中最重要的關鍵,因此以現有的炭疽病菌基因體資料庫,搜尋適合的目標區域,並以臺灣草苺炭疽病菌的序列進行引子設計,開發巢式聚合酶鏈鎖反應技術。本技術可以偵測最主要的炭疽病菌C. siamense 與C. fructicola,但不會偵測到其他草苺病原菌或土壤中常見的腐生菌,可偵測到低至100 fg 之C. siamense DNA ( 約2 個病原菌細胞),代表具有高度專一性及靈敏度。
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