最新遺傳研究全面揭示西瓜的遺傳密碼
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文章來源 : 農業科技決策資訊平台 2019-11-13
現在被人們所熟知的西瓜(cultivated watermelon, Citrullus lanatus)之所以果實飽滿且香甜係因農民長時間選育的結果。由於西瓜是各地常見的經濟作物，廣為全球栽培，且西瓜也是眾多消費者喜愛的商品，因此除了探討以外表性狀為主的傳統選育研究外，許多研究團隊也針對西瓜的遺傳特徵進行更深入的研究，並希望以基因體(genome)尺度進行較為全面的探討。中華人民共和國北京市農林科學院蔬菜研究中心(Key Laboratory of Biology and Genetic Improvement of Horticultural Crops (North China), Beijing Key Laboratory of Vegetable Germplasm Improvement, Beijing, China)與美國博伊斯湯普森研究所(Boyce Thompson Institute)的研究團隊重新將6個野生種在內共7種西瓜以次世代定序的方式重新定序，以獲得更完整的遺傳資料。
研究團隊曾於2013年，以短序列片段定序技術(short-read sequencing)解出第一條西瓜參考基因體(first watermelon reference genome)。研究團隊根據先前的研究經驗，重新定出涵蓋7個物種共414個個體的全基因體資訊，並以此重建種間的演化關係。研究團隊也透過遺傳數據發現，育種者曾在過去20-30年間將現有的西瓜與野生種反覆雜交後，獲得可抗線蟲、耐旱、抗病害的品系。這樣藉由與野生種雜交的過程，也可望因應隨之而來的氣候變遷。【延伸閱讀】北方玉米葉枯病的毒性基因標定與遺傳特性
研究團隊根據現有的數據，也可重新還原西瓜種化歷程與育種的歷史，為後續育種提供強而有力的遺傳資料。
該研究由美國農業部(United States Department of Agriculture)、中華人民共和國科學技術部(Ministry of Science and Technology)等機構資助。相關研究成果已發表在<Nature Genetics>。
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