香莢蘭的花序是總狀花序或複總狀花序，花梗短，花梗基部有一枚呈三角形的苞片，苞片有保護幼小花蕾的作用。花芽大部分著生長在前一年生的莖蔓上，連節著生，或隔一節至數節著生。花序始於葉腋，以螺旋狀的方式排列於花軸上，花序會集中在光線充足的地方，一個花序最多可以開100朵以上的花，但大多開約20朵左右，以螺旋狀陸續發育成熟開花，花朵顏色為淺黃綠色，盛開的花朵略有清香，有一個長筒狀的唇瓣。

臺灣種植的香莢蘭花期約在3月至6月中，花朵在午夜開始開放，近中午時花被收攏，下午3點就凋謝，每一朵花的壽命只有短短十數小時。

花穗從花芽形成到末花期約需120天，香莢蘭花期要求的日均溫為20℃以上，相對濕度為75%以上。低溫對香莢蘭開花有明顯的影響，連續低溫，會延遲開花，有部分花蕾受寒害。香莢蘭需要人工授粉才能結莢，影響香莢蘭授粉成功率的主要因素是授粉時間，授粉的最佳時間為5:00～11:00AM，此外天氣狀況與授粉成功率也有關係，晴天和陰天授粉成功率高，下雨對授粉影響較大，成功率會大幅下降。