第一棟木屋為位於六龜研究中心之扇平工作站之通舖，建於1937年，1996年拆除，拆除共費29工，其中5 工為廢料清理及搬運。木屋以瓜柱承接檁條，屬穿斗式構架。木屋座東南朝西北，呈倒T字型，室內面積約104 m2(平方公尺)。 地基周邊為高45 cm帶通氣窗的混凝土勒腳牆，其上承接紅檜地檻。地板樑在通舖兩側因距外圍較近，故使用高耐腐性的紅檜，通舖中央因強度需求大，亦使用紅檜，均由混凝土地板支柱支撐；其餘使用杉木剝皮原木為地板樑，由直接座落於一塊頁岩上的杉木地板支柱支撐；地板樑上方有長方形刻槽，以承接平行面闊方向之柳杉地板托樑，紅檜地板則釘於地板托樑上。地檻及紅檜地板樑，四面均塗有煤焦油以防腐。

屋身為露柱式構造，柳杉屋柱上承屋頂構架材(簷枋或屋架大樑)，下接地檻或紅檜地板樑。兩屋柱間有間柱及橫向灰板條，附以竹條編成之格子網，覆以泥土後，表面再塗以白色石灰，構成內部的編竹灰泥牆；外壁則釘以雨淋板，板上塗刷有柏油。間柱及灰板條並不負承重之責，僅作為編竹灰泥牆之骨幹。屋頂構架最下為簷枋，其上搭以屋架大樑，再以瓜柱直接承接檁條，檁條上釘以椽條，椽條上釘以橫向柳杉望板，再覆以油毛氈及鐵皮浪板。 以外觀而言，木屋整體結構完好無損，但有下列損毀：浴室外牆之窗檻因濕度太高，有腐朽發生；靠浴室的地檻，雖然使用耐腐力強之紅檜，也有類似情形，此處地檻上之兩根柳杉屋柱下端，有嚴重腐朽。木屋背山，左側有作辦公室用之二層建物為屏障，故被覆之雨淋板均完整；右側山牆則直接受到日曬雨淋，而有風化現象，雨淋板之春材部份陷入材面0.4 至0.7 cm，據文獻指出每10年春材平均風化0.1 cm；位於右側山牆與正面所成屋角之雨淋板發生腐朽，導致所被覆之角柱腐朽，角柱下端插入地檻之平榫已破壞，唯不影響結構安全；走道外圍之廊柱表面有風化現象，其下端埋入混凝土基墩之部份，均有腐朽發生。

位於六龜研究中心之倉庫，建於1950~1960間，2005年拆除，中柱式三角桁架構成人字屋頂，座北朝南，室內面積約140 m2(平方公尺)​。混凝土地基上為高27cm之勒腳牆，其上為塗煤焦油之紅檜地檻，室內為混凝土地面無地板構架。柳杉屋柱及間柱以平榫插入地檻，塗柏油之柳杉板材為雨淋板，無內壁板及天花板。屋頂構架內為八個三角桁架，由檁條連結，檁條延伸至南北二端由瓜柱支撐，再覆以縱向柳杉望板、油毛氈、及鐵皮浪板。全棟除地檻外，全部構材（屋柱、間柱、桁架等）受白蟻嚴重侵襲，可輕易以木棍刺穿。防護措施有塗煤焦油、耐腐性強之紅檜地檻，於屋角相交之雨淋板有鐵片防護，及封簷板保護檁條端部。拆除時除全棟受白蟻侵襲外，雨淋板雖外塗柏油，但大部分已消退，導致春材部分風化嚴重、且有節處大部分脫落。