石斛蘭屬於附生植物，在原生環境中其根系附著於樹幹表面，故與許多附生蘭一樣，根部不能耐受積水。在盆植的環境中，可由手觸摸介質，待介質接近乾燥時澆水，每次澆水時要澆透，讓介質充分含水，可由多餘的水分已從盆底流出作為澆透的判斷。但不可過度頻繁澆水以致介質長期積水，如此容易導致爛根。但板植的石斛蘭則沒有此問題，因為板植非常接近原生態的狀態，沒有積水的條件，可以較常澆水。

澆水的頻率會因植株所在的環境而有所不同，日照較強、空氣濕度較低、蒸散較快的環境會需要更頻繁的給水，保水度低的介質會比保水度高的介質需要更頻繁的給水，例如樹皮就比水苔保水度低，水分流失更快。孔隙較大的介質保水度會比孔隙小的介質來得低，需要更經常給水。此外，每個植株的生長狀況或品種差異也可能影響對水分的需求，因此給水的頻度應由栽培者自行觀察判斷，並且依天氣調整，判斷的方式則如前段所述。

空氣濕度方面，多數種類的石斛蘭通常喜歡50%至70%的相對濕度。在台灣的室外環境多可符合此一條件，不必特別調整。惟配合光照條件不要種在全日照的環境就好，以半日照、半遮蔭為宜。

原則上，種植石斛蘭的水分控管並不困難，可以把乾濕循環當成是附生蘭種植的一種基本原則。石斛蘭膨大的假球莖可以儲存水分，短期的缺水不會造成問題。澆水時，可以避開中午，以免造成水分在植物體上形成燒灼，如果植株有花也避免淋在花上，以免落花。

另外可以特別注意，在冬季氣溫轉冷後，石斛蘭可以開始節水。春石斛在轉冷後會落葉，若在天氣轉冷後不節水，隔年可能形成高芽（營養芽）而非花芽，影響開花。秋石斛不喜歡低溫的環境，冬季減少澆水可以助其渡冬。此外秋石斛在秋天花季之時，其假球莖成熟膨大，此時也可節水一兩週，促其抽出花梗。