海草為澤瀉亞綱Alismatidae，包括西冬科Posidoniaceae、絲粉藻科Cymodoceaceae、甘藻科Zosteraceae及水鱉科Hydrocharitaceae等4科。

目前全世界已記錄的海草共有12屬60種。鄰近的菲律賓有記錄13種（1983年）、琉球11種（1997年）、日本（含琉球）15種（1962年）、海南島6種（1992年），在台灣則有3科6屬10種（2004年），其中在澎湖海域所紀錄的種類則僅有3種。2010年針對澎湖周邊海域進行調查，所記錄的海草種類又增加了2種，使澎湖的海草種類增加到了2科3屬5種。本單元將澎湖海域所發現的5種海草種類及分布現況進一步介紹。

毛葉鹽藻生態照（赤馬水深3m）