健康苦瓜種苗是成功栽培苦瓜最基本的工作。育苗工作需注意種子播種前處理及催芽等工作，而苗期管理則包括水分及病蟲害管理等工作。

（一）種子處理及催芽播種
苦瓜種子適合發芽溫度為30~35℃。栽培種大苦瓜於播種前要先破殼，以幫助種子吸水，加速發芽。可利用瓜子夾，將種子外殼輕輕夾破即可。破殼後，以流動水浸種12~24小時。浸種後，再以30℃催芽24小時，或催至胚根露出外殼後，才播入穴盤。夏季高溫期在浸種後，則可直接播種到穴盤。

播種時，可用50格穴盤，將發根種子或處理過的種子置於介質內，再覆蓋種子厚度1-2倍的介質。


（二）苗期管理要點
最須注意水分的控制。注意早晚給水，保持土壤濕潤。在第二片本葉展開以後，水分供應不可過多，上午及傍晚各澆水一次即可。以減少病害發生及苗株徒長的情形。苦瓜苗期需要較充足的光線，採用一般透明塑膠布育苗設施的光線即可。

苗期植株對病蟲害抵抗力較弱，必須注意預防工作，特別是粉蝨等病毒病媒介昆蟲，更須從苗期做好防治，採用溫網室育苗最佳。如過葉片出現紗網狀食痕，多為夜盜蟲幼蟲危害，須以藥劑處理，待苗株展開至3~5片本葉時定植為最佳。