蘭嶼島上原生豬種遺傳特性已受外來基因所影響，民國69年蘭嶼豬的引種，使純系血脈得以在畜產試驗所保存，也突顯落實種原管理與維護遺傳多樣性之重要性。

工作團隊也很期待未來在各方環境條件得以配合下，將蘭嶼豬種原回流原生地。解決之道應結合學術單位、地方行政機關與關注傳統文化之部落團體等資源與影響力，共同研商可行之方案，並藉由解說與溝通，喚起當地住民自覺，配合計畫施行，方能達成目標。

畜產試驗所於101年起主動與蘭嶼鄉公所及部落團體接觸，研商蘭嶼豬種原回鄉事宜。