蘭嶼是台灣小型豬的發源地，近年調查發現，島上豬隻雖維持一定數量(約一至二千頭)，大部分屬小戶飼養，其中以2~5頭最多，計有小欄圈養、自由放養與集中圈養三種飼養型態，傳統餵飼以水芋與甘藷為主，再佐以廚餘。

因陸續引進外來豬種雜交繁殖，導致部分豬隻有程度不一的雜交特徵，如白肩帶、紅棕與全白的毛色表現，過大與下垂的耳朵，以及粗大的鼻吻，甚至從本島引進野豬飼養與雜交。在當地傳統的飼養與繁殖方式下，豬隻多能自由活動與逢機交配，外來種原遺傳滲入的程度將會與時俱增。