由試驗結果顯示，當歸最適合的收穫時期是在植株開花的初期，此時當歸的根部產量最高，而且有效成分含量較多，當歸根部的質地也較軟，品質較好。若是在當歸開花後到種子成熟期間才採收根部，由於根部已逐漸木質化，此時收穫的品質較差，而且根部的產量也較低；若是在種子成熟後，地上植株接近凋亡時來採收根部，此時根部已經木質化，產量與品質皆最差。一般而言，當歸種植8-10個月後為其收穫適期，在收穫時要避免根部的損傷，否則會影響根部品質。若當歸種植時是採用種子直播的方式，所採收的當歸根部具有主根，其分支會較少；然而若是當歸的種植方式，是先育苗後再移植到田間栽培，則採收的當歸根部其鬚根會較多。