柿樹根系因對土壤養分濃度及氮素含量相當敏感，因此，冬季落葉後，宜多施粗纖維質的腐熟之有機質肥料如蔗渣堆肥做基肥，以增加土壤緩衝能力。如要自行調製堆肥時，可利用蔗渣堆肥添加少量骨粉及豆粕、箆麻粕、油菜子粕等有機材質，進行堆製，待充分腐熟後施用，切忌直接施用生雞糞，以免造成肥傷。如要直接施用未腐熟之豆粕、箆麻粕、油菜子粕等有機質肥料時，宜提早在落葉前施用，撒施土面，不宜埋入土中，以免在腐熟過程中燒傷細根。施用腐熟的粗質有機肥每株以不超過40公斤為宜，因若連年施用過多有機肥時，土壤中亦容易蓄積過量的磷、鉀，產生缺鎂症狀。其餘未經腐熟的家畜糞便亦儘量避免施用，以免果園蒼蠅滿天飛，且容易導致鹽分或氮肥過高，延遲成熟且品質較差，甚至造成落果。有些市面銷售成分標示不清的有機質肥料，為了凸顯肥效，摻雜速效性化學肥料，容易造成肥傷，宜特別注意。