常見的南瓜栽培種類可以分成五大類，分別為：中國南瓜（C. moschata）、印度南瓜（又名西洋南瓜；C. maxima）、美國南瓜（C. pepo）、黑子南瓜(C. ficifolia) 及墨西哥南瓜(C. mixta)，其中印度南瓜、中國南瓜及美國南瓜中的「冬南瓜」品種是在果實成熟時才採收、食用，而美國南瓜中另有一類「夏南瓜」，因果實完熟後肉質粗鬆且外皮堅硬，不適合食用，以採收嫩果為主。黑子南瓜的嫩瓜可鮮食及醃漬外，對蔓割病具有良好的抗病性，常被用作嫁接胡瓜、西瓜及洋香瓜的根砧。墨西哥南瓜在中南美洲亦有做蔬菜食用。