文旦是屬於柑桔類果樹的一種，柑桔類果樹是全世界非常重要的果樹產業，常見的橘子、柳丁、葡萄柚等屬柑桔類果樹的範圍。柑桔類下分幾個大項，其中一項是柚類，柚類中又包含許多柚子，如泰國柚等，而文旦就是屬於柚類中的一種。
文旦正式的名稱應該是「麻豆文旦」，因為文旦雖然是從大陸引進台灣種植，但是後來在麻豆這個地方種植的文旦發生突變，品質因此變得更好，為此眾人開會後決定改名為麻豆文旦，以確定這個突變後的文旦是一個新的品種。不過可能因為麻豆文旦唸起來有點長，不太好唸，所以大家還是習慣稱為文旦或文旦柚。至於一開始為什麼被稱為文旦？相傳是因為最早是由一位姓文的小旦所種植，所以就被稱為文旦嘍。