染色體係由DNA與蛋白質所組成。動物之染色體數目隨種別而有所差異。鹿隻之染色體數目，常因亞種與報告作者之不同，即在同一種內，亦有變異。
北海道花鹿(C. n. yesoensis)之2n為68，基本臂數(number fundamental; NF)(即染色體之總臂數)為70。日本梅花鹿(C. nippon nippon)之2n為67，NF為70。但伍本公園梅花鹿群2n有為64、65、66、67、甚或68者，而NF皆為70。臺灣梅花鹿(C. n. taiouanus)之2n為66，NF亦為70。C. n. nippon與C. n. yesoensis雜交後所產之子代，其2n分別有65、66、67與68者，NF則均為70。凡此皆顯示梅花鹿不同亞種間之染色體數，可能有所差異，但其基本臂數則屬不變，皆為70。
水鹿染色體之2n，在各不同亞種間亦有出入。印度水鹿(C. unicolor unicolor)之2n為58，NF為70。C. u. cambojensis之2n為62。台灣水鹿(C. u. swinhoei)之2n為62，NF為70。
麂之染色體數目遠較其他鹿種為少，但麂屬各種間之差異極大。Muntiacus reevesi之2n為46。M. muntjak雄性之2n為7或9，而雌性者為6或8，但NF則均為12。而雌性M. feae之2n分別有為12、13與14者。M. crinifrons雌性之2n為8，而雄性者為9。
牙獐(Hydropotes inermis)與灰色墨西哥鹿(grey brocket deer; Mazama gouazoubira)之2n均為70，其中68個為單臂體染色體(avrocentric autosome)，1個為單臂X-染色體 (avrocentric X chromosome)。所有已被研究之遠位掌骨鹿(telemetacarpalian deer)，除M. gouazoubira外，均具有一個等臂X染色體(metacentric X chromosome)。
糜具有旁心倒置(pericentric或paracentric inversion)之體染色體一對，而將體染色體之臂數，自68增加至70。