明朝吳承恩所撰神話小說「西遊記」描述：「太上老君煉成的神丹妙藥，總是裝在葫蘆內」。儘管這是神話故事，但葫蘆裝藥卻是真實生活的寫照。扁蒲入藥始載于南朝梁代「本草經集注」，藥用部為果實、果皮、種子。
中醫認為其性平微寒味甘淡無毒，入肺、脾、腎三經。能利尿通淋，除煩潤肺，清熱解毒，為水腫、鼓脹、黃疸之要藥。「滇南本草」載瓠瓜”利水道，通淋，除心肺煩熱”。
「本草綱目」葫蘆條附30餘方，遍述治風痰鼻窒、頭痛目眩、風虫牙痛、四肢浮腫等多種疾患。此外，作瓢具的葫蘆殼又稱蒲殼，亦可供藥用。扁蒲有時會有苦味者，不能入藥，因為無所療效且亦難下嚥。