1、土壤品質衰退，地表土壤流失，生產成本及能源投入逐年增高。
2、大量施用化學肥料及農藥，導致生態平衡的破壞及環境品質的劣化。
3、雜草與昆蟲及病原菌度農業之抵抗性增加。
4、農藥之使用影響有益昆蟲及土壤微生物。
5、生產的農產品風味及營養價值比較低，且可能汙染到化學殘留物。
6、現代農耕法，單位面積產量顯著提高，生產過剩，農產品價格低迷。