一般人以為使用禽畜糞或認為回覆到以前方法即是施行有機農業，實為錯誤觀念且實際上並非如此。以下就研究人員實際研究的經驗及心得，提出目前應用於水到栽培管理方面的小撇步，供有興趣從事有機水稻之農民或對此議題感興趣之民眾參考。

1. 選擇栽培地點與品種之小撇步：首先確認土壤與水質有無污染，其次應考量土壤肥沃度且盡量避免病蟲害益嚴重發生的地區；在品種方面，應以國人消費趨勢為導向。
2. 土壤管理：第一次整地應配合有機堆肥之施用，如稻草或前期作物。插秧作業宜於整地後2-3天進行，此外要依據土壤質地及肥力來選擇有機質肥料。
3. 灌排水管理：可依據水稻生育階段對水分的不同需求來調整灌溉排水之方法，不僅可節約用水，又可提高養份之有效性及稻根之活性。
4. 雜草防除與管理：有機農業系統對雜草的防治，應著重於預防、下決定之時機及控制的技巧，如可用重覆整地法、稻殼覆蓋淹水法、高溫防除法。
5. 病蟲害管理：可使用抗病(蟲)或耐病(蟲)品種，再來可使用非農藥方法消滅病(蟲)源，甚至可製造一個不利病蟲害發生的環境。
6. 收穫與調製：當稻田的全部稻穗成金黃色而穗莖部尚有2-3粒青穀時，為收穫最適宜；調製過程以45-55度C間歇性調製稻穀至水分含量14-15%，儲存於冷藏庫中。

改寫自：陳烈夫、陳志昇、呂秀英(2005)。解析水稻有機栽培管理小撇步－許農民一美好的永續未來。農業試驗所技術服務，第62期。