北柴胡屬於多年生草本，株高85~125cm，分蘗數1~6，平均3，全株光滑無毛，根直立，根頭直徑2.5cm，根重約7.3g，根生葉廣線狀披針形，先端銳尖，莖生葉多數，互生，倒披針形；最大葉長約15 cm，寬約1.5 cm。複繖形花序腋生兼頂生，花黃色，小花梗長約2cm，雙懸果長圓狀橢圓形，長約3mm，花期8~9月，果期9~10月。
野生的高氏柴胡分佈於台灣北部及中部，原本即甚稀少，近來經人採集更屬少見，屬於多年生草本，株高110-135cm，分蘗數4~15，平均8，全株光滑無毛，根直立，根頭直徑2.7cm，根重可達9.5g，根生葉長橢圓披針形，先端銳尖，莖生葉多數，倒披針形；最大葉長約15 cm，寬約1.0 cm。花黃色，小花梗長 1-3cm，果實橢圓形，長 2-3mm，直徑 1-1.5mm，花期5~9月，果期8~11月。
三島柴胡台農一號之植株生育強健，一年生株高可達110-140cm，分蘗數1，根直立，根頭直徑2.5cm，根重約5.6g，莖直立質堅，葉互生，植株下半部葉形較大，葉長約 15cm ，寬約 1.5cm，花為複繖形花序，果實為裂果，種子長橢圓形，千粒重僅 1.23-1.68g，花期4~8月，果期8~11月。三島柴胡台農一號之親本源自日本之三島柴胡，本所自民國57年引入三島柴胡種子後，即利用混合選種法，淘汰生產力低落及品質較劣植株，選拔生長勢旺盛及高 saponin含量之健株，共經七年選種而成。
依據文獻及本所試驗結果可知，高氏柴胡與三島柴胡台農一號的主要區別如下：在染色体數方面，三島柴胡染色体數為 2n=16，高氏柴胡為12；在田間發芽及生長特性方面，高氏柴胡之發芽率稍高，分蘗能力旺盛，且較耐旱；在品質及藥效方面，依據高雄醫學大學試驗結果可知，高氏柴胡之品質及藥效都較北柴胡及三島柴胡有過之而無不及。
除了前述三種外，其他較重要且值得引進開發之柴胡品種如下：長白柴胡（B. komarovianum Lincz.）、興安柴胡（B. sibiricum Vest）、長莖柴胡（B. longicaule Wall. ex DC.）、狹葉柴胡（B. scorzonerifolium Willd.）、金黃柴胡（B. aureum Fisch.）、多脈柴胡（B. multinerve DC.）、銀州柴胡（B. yinchowense Shan et Y. Li）、線葉柴胡（B. angustissimum (Franch.) Kitagawa）、多枝柴胡（B. polyclonum Y. Li et S. L. Pan）、窄竹葉柴胡（B. marginatum Wall. ex DC. Var. stenophyllum Shan et Y. Li）、錐葉柴胡（B. bicaule Helm）、小葉黑柴胡（B. smithii Wolff var. parvifolium Shan et Y. Li）、大葉柴胡（B. longeradiatum Turcz.）、黑柴胡（B. smithii Wolff）、阿爾泰柴胡（B. kryloviam Schischk. ex Kryl.）、四川柴胡（B. sichuanense S. L. Pan et Hsu）、韭葉柴胡（B. kunmingense Y. Li et S. L. Pan）、瀘西柴胡（B. luxinese Y. Li et S. L. Pan）、川滇柴胡（B. candolle Wall. ex DC.）、柴首（B. chaishoui Shan et Sheh）、空心柴胡（B. longicaule Wall. ex DC. var. franchetii de Boiss.）、汶川柴胡（B. wenchuanese Shan et Y. Li）、麗江柴胡（B. rockii Wolff）、細莖有柄柴胡（B. petilulatum Franch. var. tenerum Shan et Y. Li）、小柴胡（B. tenue Buch.-Ham. Ex D. Don ）、馬爾康柴胡（B. malconense Shan et Y. Li）、黃花鴨跖柴胡（B. commelynoideum de Boiss. var. flaviflorum Shan et Y. Li）等。
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