觀賞魚活體的包裝處理，多在長距離與長時間的空運過程中，展現其無以取代的技術性，同時亦藉由運輸後個體的活存與後續飼養表現，衡斷供應商所具有備專業能力與技巧的高低。因為隨著包裝與運送對象的不同種類、體型與來源，往往在包裝方式上，存在著截然不同的明顯差異，因此富於經驗的水族貿易商，往往能藉由包裝方式，直接判斷個體的供應來源、品質、價格與活存率。

       與觀賞魚包裝最為密切，同時也直接關係運輸後個體活存狀態的，便是包裝環境下的水體控制。由於包裝環境下，不如一般的飼養環境，擁有效率優異的過濾或循環系統；加上除非單隻包裝，否則多半呈現在有限水體下，密度極高的混合包裝，因此包裝環境中的水體品質，便成為極為重要的關鍵。要維持包裝環境與運輸過程中，水體的潔淨與穩定，這種工作往往需要從預備出貨的前幾天就開始進行。例如預備包裝或運輸的魚隻，必須被蓄養在空間足夠同時具有穩定水質的裸缸中，在充分進行檢疫與健康管理同時，還需徹底執行飢餓處理，以避免個體在長時間、長距離與高密度的包裝下，產生吐料或排泄等嚴重污染水質的情況。此外包裝水體的來源也必須清潔乾淨，同時與用以蓄養的水質條件相同，才不致使個體在更換環境下所產生的緊迫 (stress)，進而增加氧氣消耗，或在大量分泌黏液下造成對水質的污染。

        如果對於個體可能在運輸過程中，藉由排泄產生諸如氨或亞硝酸等含氮廢物，或是過量分泌的黏液造成水體出現不量氣味、混濁與黏稠等情況，則不妨可在包裝水體中事先投入些許麥飯石、燒結沸石或活性碳，這些具有優異吸附能力的多孔隙濾材，多可在不影響水質條件的狀況下，有效消弭水色與氣味，甚至對於穩定水質與提升活存率，有著相當傑出的表現。

       適當的降溫也可有效降低水質污染的速率，因此部分東南亞國家，在運輸觀賞魚時，會在以保麗龍為材質的包裝箱內側，置入能和緩降低溫度的「冰寶」。藉由降溫調節將溫度控制在穩定的22-24℃間，除可降低運送生物的代謝速率，避免水質的污染，同時對於降低緊迫，或提升包裝密度與活存率，相關效果亦獲得證實。不過在使用這類降溫劑時，請格外留意勿使其直接接觸包裝水體或生物，同時擺設位置也常貼放於上蓋內側，以避免低溫直接刺激，造成接觸生物感到不適。相對的，長距離的高空運輸，或是由歐洲線與南美線輸入的觀賞魚，由於運輸過程中常受高空低溫影響，因此反倒會在包裝箱內使用暖包，相關使用方式與注意事項，也多與降溫劑相同。

       包裝同時的充氧，也是運送觀賞魚時極為重要的工作。熟稔包裝作業程序的操作者，會依序在注入定量水體與放入魚隻後，將袋中多餘的空氣擠出，然後藉由高壓鋼瓶的壓力，將純氧灌注其中。充氧比例與體積，往往會隨魚種、體型大小、運送時間與距離，而有不同的差異，不過在長時間與長距離的運送下，包裝柔軟的袋子，往往在放置或對抗壓力改變時，有著較飽滿包裝更加的適應性。