花蓮區農業專訊--花蓮地區山林土壤調查與菌相分析--01 - 農業知識入口網

前言

土壤為微生物生長最密集的區域，土壤中之微生物組成主要為細菌（佔97%)，其次為真菌（3%)，Luiz等人於2007年估算1公克土壤可能有超過800萬種不同的細菌。土壤是各種微生物的寶庫，市面上諸多生物農藥菌種與微生物資材，如液化澱粉芽孢桿菌Ba-BPD1、TCB428、YCMA1 ；貝萊斯芽孢桿菌KHH13等皆自土壤分離而得。隨著生物資訊技術增進，目前已能快速且大量的解析土壤中各種微生物，讓環境基因體學（Metagenomics)成為研究土壤菌相的主流。環境基因體學是從環境中獲取基因體遺傳物質進行研究，可以由土壤、溪流、海洋，甚至人體腸道組織取得微生物的核酸物質，經大量快速的定序與生物資訊分析後，了解菌種種類與比例等菌相資料，包括高達3,000甚至10,000筆的菌種分類，此時就需要利用各種生物分析軟體進行整合歸納，將資料圖表化輔以顏色表示，才能從繁雜的資料中找出異同。